MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 14509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	TG	3	6	36	41	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017646	A	7	7	46	52	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017646	AGC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017646	CAGA	2	8	155	162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017646	ACA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017646	CAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017646	ACC	3	9	213	221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017646	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017646	T	8	8	301	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017646	AAC	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017646	T	6	6	5069	5074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017646	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017646	AAC	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017646	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017646	A	7	7	6381	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017646	AAG	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017646	TA	3	6	7910	7915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017646	GGCG	2	8	7972	7979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017646	CGG	2	6	8036	8041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017646	CGT	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017646	ATC	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017646	ACC	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017646	CTGT	2	8	9125	9132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017646	C	6	6	9785	9790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_017646	G	6	6	9795	9800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017646	ATC	3	9	10392	10400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017646	GAAT	2	8	10401	10408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017646	AAT	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017646	ATA	2	6	10455	10460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017646	GAAAAT	2	12	10498	10509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017646	CTG	2	6	11721	11726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017646	AGA	2	6	11733	11738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017646	TTA	2	6	11762	11767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017646	TCAT	2	8	11794	11801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017646	A	6	6	11876	11881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017646	TGA	2	6	11899	11904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017646	TAG	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017646	AGTG	2	8	11938	11945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017646	A	7	7	11953	11959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017646	ATG	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017646	AT	3	6	12026	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017646	A	6	6	14045	14050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017646	CCG	2	6	15274	15279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017646	GACA	2	8	15568	15575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017646	CGC	2	6	15588	15593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017646	TAT	2	6	15594	15599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017646	CT	3	6	15604	15609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017646	AATC	2	8	15665	15672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017646	TTA	2	6	15767	15772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017646	AGA	2	6	15787	15792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017646	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017646	AC	3	6	15874	15879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017646	AATG	2	8	16029	16036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017646	TCA	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017646	AAT	2	6	16824	16829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017646	ATA	2	6	18335	18340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017646	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017646	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017646	ATA	2	6	18424	18429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017646	TAT	2	6	19712	19717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017646	TAAT	2	8	19727	19734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017646	CTCAT	2	10	19810	19819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017646	TGA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017646	A	6	6	19851	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017646	ATT	2	6	19860	19865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017646	GAT	2	6	19890	19895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017646	GA	3	6	21169	21174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017646	AT	4	8	23099	23106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017646	GTTTT	2	10	23107	23116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017646	TCA	2	6	23161	23166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017646	TA	3	6	23313	23318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017646	AAT	2	6	23379	23384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017646	TTTCAC	2	12	23408	23419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017646	ATC	2	6	23461	23466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017646	AAC	2	6	23475	23480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017646	TGTT	2	8	23492	23499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017646	GC	3	6	23525	23530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017646	GTTA	2	8	23577	23584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017646	ACC	2	6	23592	23597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017646	ACT	2	6	23616	23621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017646	CCA	2	6	23629	23634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017646	ATT	2	6	23724	23729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017646	TTG	3	9	23730	23738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017646	AT	3	6	23748	23753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017646	TTG	2	6	23803	23808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017646	ATC	2	6	23877	23882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017646	C	6	6	23882	23887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_017646	CTC	2	6	23922	23927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017646	TCA	2	6	23941	23946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017646	TGGC	2	8	23953	23960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017646	ATT	2	6	24078	24083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017646	T	6	6	24118	24123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017646	TGA	2	6	24157	24162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017646	TTTAT	2	10	24163	24172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017646	GGC	2	6	24228	24233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017646	TAT	2	6	24269	24274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017646	ATT	2	6	24312	24317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017646	TAC	2	6	24323	24328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017646	TTG	2	6	24442	24447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017646	AT	4	8	24453	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017646	TCC	2	6	24478	24483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017646	AT	3	6	24498	24503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017646	GCA	2	6	24548	24553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017646	GAAC	2	8	24586	24593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017646	AG	3	6	24829	24834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017646	TGAG	2	8	24842	24849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017646	ATC	2	6	24949	24954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017646	TAAA	2	8	24993	25000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017646	TTA	2	6	25043	25048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017646	AGG	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017646	A	6	6	25092	25097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017646	CCA	2	6	25214	25219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017646	TCT	2	6	25250	25255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017646	AGC	2	6	25292	25297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017646	T	6	6	25345	25350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017646	GTT	2	6	25404	25409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017646	TAT	2	6	25410	25415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017646	GCC	2	6	25450	25455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017646	TTC	2	6	25480	25485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017646	A	7	7	25508	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017646	AGC	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017646	GTC	2	6	25535	25540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017646	ATA	2	6	26260	26265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017646	A	6	6	26286	26291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017646	ATC	2	6	26830	26835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017646	TTAA	2	8	26837	26844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017646	GTT	2	6	26890	26895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017646	ATT	2	6	26896	26901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017646	T	6	6	26918	26923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017646	TGA	2	6	26942	26947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017646	CTT	2	6	26980	26985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017646	AAG	2	6	26989	26994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017646	CAT	2	6	27005	27010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017646	ATT	2	6	27049	27054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017646	T	6	6	27053	27058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017646	TAA	2	6	27076	27081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017646	TCA	2	6	27082	27087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017646	CTT	2	6	27111	27116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017646	TGA	2	6	28566	28571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017646	TTAAT	2	10	28579	28588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017646	ACT	2	6	28604	28609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017646	AAG	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017646	ATAA	2	8	28645	28652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017646	TAA	2	6	28678	28683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017646	TAA	2	6	28695	28700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017646	GAT	2	6	28854	28859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017646	AG	3	6	28888	28893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017646	GT	3	6	28947	28952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017646	CA	3	6	28958	28963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017646	AGC	2	6	28970	28975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017646	A	7	7	28982	28988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017646	GC	3	6	29265	29270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017646	CTT	2	6	29360	29365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017646	GCA	2	6	29483	29488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017646	TTC	2	6	29499	29504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017646	CTT	2	6	29536	29541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017646	CATA	2	8	29642	29649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_017646	AAG	2	6	29668	29673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017646	TGC	2	6	33948	33953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017646	AGC	2	6	35415	35420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017646	T	6	6	35457	35462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017646	TCAT	2	8	36414	36421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017646	TCCC	2	8	36444	36451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
164	NC_017646	TGGC	2	8	36485	36492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
165	NC_017646	TGT	2	6	37521	37526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017646	T	6	6	37557	37562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017646	TCT	2	6	37586	37591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017646	TGC	2	6	37592	37597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017646	TCG	2	6	37745	37750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_017646	TGA	2	6	42337	42342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_017646	GAT	2	6	42885	42890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017646	GATGC	2	10	42911	42920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_017646	CCAG	2	8	42952	42959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_017646	CGC	2	6	42977	42982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_017646	GCG	2	6	47370	47375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017646	ATTT	2	8	50170	50177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017646	T	6	6	50300	50305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017646	TGA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017646	A	7	7	50376	50382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017646	CTG	2	6	87597	87602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017646	T	6	6	87605	87610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_017646	T	6	6	92395	92400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017646	AGA	2	6	92455	92460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017646	TAG	4	12	92467	92478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017646	CAA	2	6	92577	92582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_017646	GTT	2	6	160561	160566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017646	TTG	2	6	160568	160573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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